Игровой процесс Rise and Fall: Civilizations at War максимально схож с культовыми RTS-играми, типа Age of Empires или Казаки. Игра рассказывает альтернативную историю и повествует о неслучившихся войнах древности. В конфликте принимают участие Египет, Греция, Персия и Рим. Как и в любой классической стратегии, в Rise & Fall: Война Цивилизаций требуется собирать ресурсы, строить здания, нанимать войско и воевать с противниками.

Представлено три вида ресурсов: золото, дерево и очки славы. Последний пункт - самый главный элемент геймплея, поскольку с помощью него прокачиваются юниты, постройки, нанимаются советники и т.д. Очки славы можно заработать в бою, поэтому геймплей всегда старается подталкивать участников к боевым действиям, повышая тем самым интенсивность игрового процесса. Однако можно добывать очки при помощи строительства специальных памятников. Другие ресурсы в Rise and Fall: Civilizations at War добываются классическим способом - при помощи рабочих.

Войско и юниты нанимаются в Городском центре. Солдаты делятся на мечников, копейщиков, лучников, метателей копий, всадников и различной осадной техники, типа катапульт, башен, морских посудин, колесниц и боевых слонов. Герои имеют большой запас здоровья и уникальные навыки. На карте расположены специальные амброзии. Их может поднимать исключительно герой. Протагонисты носят по два меча и лук со стрелами. Героями представлены Клеопатра, Александр Македонский, Юлий Цезарь, Рамзес, Тор и т.д. Есть несколько полноценных кампаний и рандомные карты для сражений.