CometStriker DX рассказывает о лейтенанте, что спасает родную планету от космической станции. Эта база не простая, а живая. Она пожирает все вокруг. Для её уничтожения надо использовать пушку планетарной защиты. Герой путешествует по другим мирам в поисках древних энергетических ядер, чтобы с их помощью зарядить это оружие.

CometStriker можно отнести к двухмерным экшенам с видом сбоку. Бои проходят в пределах одного экрана. Управление персонажем задействует минимум кнопок. Он может стрелять влево и вправо, летать в 8 направлениях и ускоряться. На локациях встречаются усиления. Помимо главного героя здесь есть пять персонажей, за которых тоже разрешают играть. Их можно разблокировать по мере прохождения.

Кампания состоит из 5 этапов с обычными противниками, мини-боссами и главарями. На выбор дают 4 типа сложности. Обычные карты линейны, но в них присутствуют разные маршруты. Кроме основной истории тут есть лабиринт, где все этапы генерируются случайным образом (как в рогаликах), одноуровневый режим для тренировки, а также отдельные схватки с боссами. За убийство врагов дают очки. Их множитель сбивается, если герой получит урон. Со смертью протагонист теряет одну жизнь и все собранные улучшения.