Главный герой Thief: Deadly Shadows будет забирать драгоценности у богатых и оставлять себе. Ему предстоит остановить нападение Темной Эры и сразиться с Хранительницей, существом, создавшим Орден. Если он сделает это, то остановит Пророчество и возобновит равновесие во вселенной. Смертоносная ведьма Гамалл обладает многочисленной охранной.

Процесс происходит с видом от третьего лица. Данная часть включает новую систему освещения с возможностью переключения перспективы. Искусственный интеллект противников был улучшен, они начали пользоваться всеми способностями и сильнее напрягать пользователя. Игрок пройдет по Южному кварталу, начальной территории, где вырос протагонист. Здесь подопечный способен приобретать снаряжение и сбывать украденные материалы.

Гарретт из Thief 3: Deadly Shadows пользуется дубинкой, а если подойти сзади, то можно оглушить соперника. Многие противники слишком сильны, чтобы вступать с ними в открытую схватку, из-за чего геймплей предлагает множество вариантов для обхода. Сам проект создан в жанре стелса и в основном геймеру потребуется незаметно перемещаться по локации и стараться не попадаться на глаза оппонентов. Открывать сундуки можно благодаря отмычкам или сворованным ключам. Помимо дубинки, центральный персонаж применяет кинжал, лечебные напитки, бомбы и стрелы с водяными, огненными и шумовыми наконечниками.