STAR WARS Knights of the Old Republic II - The Sith Lords рассказывает историю джедая-изгнанника, который просыпается, и не понимает своего местоположения, а также личности. После первой части игры, где персонаж просыпается и ничего не помнит, прошло ровно пять лет. На инстинктах и рефлексах он улетает на черном ястребе. В этот момент нам показывают воспоминания. Оказывается, что Республика на грани распада. Ситхи и их лорды уничтожили 90% Джедаев, которые стали редким видом во всей галактике. Во всей республике остался один джедай, который не определен светлой или темной стороной — он идет к Силе, пытается восстановить связь с ней.

Все действия протагониста добавляют нам очков влияния. Мы будем путешествовать от одной планете к другой — игрок выбирает движение самостоятельно. На каждой планете будут как дружественные персонажи, которых протагонист знает, так и враждебные, с которыми предстоит драться. На этом этапе перед нами открывается владением стилями светового меча. Первый — рассчитан на массовые драки и оборону от противников; второй — бои 1 на 1.

В игре есть «влияние». Это психологический фактор, влияющий на поведение нашего визави в диалогах, а позже — на нашу репутацию. Чем выше ваше влияние, тем больше персонажу придется доказывать свою точку зрения и правоту выбора между тьмой или светом. Конкретно о событиях в сюжете разработчики говорят мало. Известно лишь то, что каждое действие ведет нас к конкретной цели, напрямую зависящей от выбора стороны. Если вы выбрали Свет, то будете искать Джедаев, чтобы спасти; если Тьму, то поиск не ограничивается убийством.