Бои в Crash Dive 2 происходят в южной части Тихого океана. Игрок управляет подводной лодкой и участвует во Второй мировой войне, сражаясь с вражескими силами. Столкновения с противниками требуют тактического искусства от пользователя. Предстоит исследовать обширные территории, охотиться на конвои противников, сражаться с боевыми эсминцами или атаковать наземные базы. Передовое вооружение позволит сбивать самолеты.

Вторая часть имеет множество нововведений и улучшений в сравнении с первым Crash Dive. Потребуется взять управление над подлодкой класса Gato. Изменена система заданий, теперь пользователи получают более понятные и удобные цели, отображенные на карте и экране. Улучшенная система повреждений поможет выключать важные функции военного транспорта противников, попадая по определенным участкам. Можно всплыть на поверхность, чтобы сразиться с летательными аппаратами и применить палубную пушку.

Зенитные орудия необходимы для устранения самолетов, пытающихся сбросить бомбы на подводные лодки. Геймер способен уворачиваться от глубинных бомб враждебных охотничьих отрядов. Геймплей совмещает реалистичный симулятор управления и аркадные перестрелки. Юзер способен скрываться от радаров, либо агрессивно себя вести и быть на виду у всех соперников. Погодные условия влияют на видимость и работоспособность вооружения. Присутствует полный цикл для и ночи. Экипаж состоит из многих юнитов, они могут умереть, получив урон от ракет или торпед. Каждый из подопечных занимается определенным делом.