События Europa Universalis 3 - Chronicles охватывают период захвата Константинополя в 1453 года и Великую французскую революцию 1789 года. В "Европа III. Золотое издание" вошли все ранее выходившие дополнения: "Войны Наполеона", "Византия", "Великие династии" и "Божественный ветер".

Основным отличием от предыдущей части является то, что многие события в игре не привязаны к истории. Также многие исторические личности не стоят во главе угла и заменены на обычных людей. В Europa Universalis 3 - Chronicles появилась возможность стартовать игру в любой день. Главной игровой особенностью стали национальные идеи, дающие те или иные преимущества. Они становятся доступными на определенном уровне развития и состоят из 12-ти идей, которые делятся на 5 категория: флот, армия, открытия, управление и культура.

Советники представлены 6-ю уровнями, каждый из которых имеет 12 специализаций: философ, натуралист, художник, политик, казначей, реформатор армии или флота, торговец, технолог, шпион, советник-колонист и дипломат. Торговые центры стали важнейшим элементом игрового процесса, т.к. туда стекается вся прибыль не только с города, но и провинций. Колонизировать позволяется любую провинцию. Когда численность населения достигает 1000 единиц, колония превращается в полноценный город. Внутренняя политика имеет несколько векторов: власть знати, централизация, инновации, меркантилизм, наступление, армия, качество и крепостное право.

Помимо возможности воевать, присутствует навык дипломатии, с помощью которого можно договориться со всеми государствами. Можно воспользоваться правом брака, чтобы заручиться союзом с той или иной страной. Армия делится на следующие типы войск: пехота, кавалерия и артиллерия и морской флот. Вера представлена 4-мя группами, состоящую из 12-ти религий: христианство, ислам, восточные религии и язычество.