Hex Empire 3 – это пошаговая стратегия. В игре карты генерируются случайным образом, но влияние рандома на геймплей только этим и ограничивается. Здесь конкретное действие всегда будет давать один и тот же результат. Элемент случайности практически отсутствует. Редактор уровней в наличии.

Инди-проект позволяет настроить очередность ходов. Можно действовать синхронно с соперниками (то есть все походили одновременно, а игра подсчитала общий результат) или ждать своей очереди. В Hex Empire 3 все события разворачиваются на глобальной карте. Обычно 6 фракций сражаются друг против друга. Можно обзаводиться союзниками и заключать с ними мирные соглашения.

Каждая сторона может перемещать по шестиугольникам свои войска и флаги. Последние нужно захватывать, чтобы одолеть оппонента. Знамена можно запрятать в столице или крупном городе, так как они лучше защищены. Юниты делятся на пехоту и артиллерию. Есть возможность передвигать не весь отряд, а только его часть. На маневры тратятся очки действий, что восполняются каждый ход. Важно завоевывать деревни, ведь они пополняют армию новыми рекрутами. Необходимо постоянно следить за доходом и моралью. Можно выступить с речью перед народом, чтобы повысить её уровень.