В Gods of Havoc: Into the Void главным героем выступает бог народа, живущего в галактике. Он не может на них влиять непосредственно, люди ведут себя независимо: развиваются, создают высокотехнологичные машины и летательные аппараты и делают другие планеты своими колониями. Бог может только указывать ход дальнейшей истории при помощи различных заклинаний: повышать размножение народа, усиливать защитный барьер на планетах, благословлять корабли или уничтожать флоты врагов. Также можно выбрать следующую планету для освоения.

Люди вырабатывают ману – единственный ресурс в игре. Она пополняется с течением времени и ее количество зависит от численности населения в галактике. Эта стратегия основана на движке RPG-Maker. В основе игрового процесса Gods of Havoc: Into the Void лежат ходы. С каждым ходом проходит время и, соответственно накапливается мана. Если ее не хватает для сильного заклинания, пополнить ее можно только ускоряя ходы и ожидая нужного количества. Прохождение может показаться скучным, так как здесь минимум действий и часто приходится просто ждать. Также есть возможность перемотки событий при помощи режима Pass-Time. После этого в журнале появляется соответствующая запись. Иногда при новом запуске игра может подвисать и возникают проблемы с созданием большой карты. В таком случае для закрытия программы нужно воспользоваться диспетчером задач.