Nanairo Reincarnation предлагает окунуться в камерный мир, созданный разработчиками. Здесь, игрок принимает облик детектива Кагами Макото у которого имеется важное задание - разыскать и изгнать из города всех призраков, нарушающих порядок города. Теперь, он уже не тот сотрудник полицейского участка, который выбивал двери ногами и во что бы то ни стало стремился помочь потерянным духам отправиться в потусторонний мир и сладить со всеми сверхъестественными преступлениями. Но это дело становится для него настоящим испытанием, и неизвестно, сможет ли он совладать с ним.

По ходу продвижения сюжета, игроку будут представлены ключевые персонажи истории - Аои, Такигава Котори, Фушими Азуса и другие. Некоторые из них будут иметь эпизодические роли, а кто-то даже начнет флиртовать с главным героем. Это показано как через диалоги, так и через интимные сцены, которых здесь немало. Большая часть геймплея сосредоточена в диалогах и индивидуальных размышлениях. Периодически, нужно принимать решения, которые в дальнейшем повлияют на сюжет и приведут к той или иной концовке. Если общение начинает надоедать, можно просто перемотать сегмент и перейти к следующему. Все локации, показанные в Nanairo Reincarnation, сохраняются в виде концепт-артов и доступны к просмотру после завершения сюжетной кампании. Это же касается и оригинального саундтрека, который открывается в галерее.