Rune Factory 4 Special погружает в вымышленный регион Селфию, где заправляет коренной владыка, дракон по имени Вентус. Пользователь попадает в ролевое приключение, совмещающее в себе симуляцию жизни. Создав персонажа в специальном редакторе, игрок попадает в мир опасностей и приключений. Главный герой или героиня, в зависимости от выбора, случайно попадает на спину летящего ящера. Правитель приглашает пожить в своих имениях, отправившись в местный замок. Предстоит заниматься помощью в управлении небольшим государством, выполнять трудные поручения и получать опыт, позволяющий прокачаться и стать сильнее.

Отправляясь в путешествия Rune Factory 4 Special, геймерам предстоит:

• Исследовать доступные территории, погружаясь в подземелья в поисках сокровищ.
  
• Участвовать в сельскохозяйственных делах, обрабатывая почву и высаживая растения.
  
• Собирать полученный урожай, занимаясь крафтингом или готовкой питательных блюд.
  
• Жить полноценно, отслеживая за состоянием протагониста. Можно отправиться на рыбалку или заняться военным ремеслом, сражаясь и добывая новые полезные предметы.
  
• Крафтить оборудование, инструменты труда или экипировку, необходимую для экспедиций в опасные регионы.
  
• Выращивать собственных созданий и монстров, стоящих на стороне игрока.
  
• Расширять круг общения, беседуя с интерактивными персонажами, живущими в окрестностях.
  
• Вступать в боевые стычки с противниками, побеждая боссов или рядовых соперников, чтобы поднять уровень.
  
• Прокачивать героя, повышая характеристики и наделяя новыми способностями.
  
• Завести дружеские или романтические отношения с другими личностями, участвующими в сюжете.