Amakano Perfect Edition повествует про паренька по имени Юки, который решается переехать с мегаполиса в небольшой городок Йомасэ-мати. Герой прибывает к бабушке с дедушкой, чтобы помочь старикам по дому и с прочими рутинными обязанностями, которые сложно выполнять в пожилом возрасте. Город большую часть года покрыт снегом из-за аномальных климатических условий. В процессе изучения нового места жительства, протагонист знакомится с тремя девушками, которых зовут Саюки, Мизуки и Кохару.

Под подстрекательством деда, юноша в Amakano Perfect Edition решается найти свою любовь и знакомится поближе с каждой из дам. Игроки будут направлять действия и поступки героя, погрузившись в сказочную визуальную новеллу, где смешивается любовная романтика и сцены интимного характера, рассчитанные на взрослый сегмент пользователей. Геймерам предстоит читать диалоги между персонажами, чтобы определяться с выбором реплик, оказывая влияние на взаимоотношения между героями романа.

В романтических приключениях, Юки сможет узнать поближе следующих девчонок:

• Такаясиро Саюки. Одноклассница паренька, которая занимается служением в местном святилище совместно со своей семьей.
  
• Канбаяси Мизуки. Любительница чая и сладостей, которая на год старше юного ухажера и тоже переехала из большого города к старикам.
  
• Хосикава Кохару. Умная и жизнерадостная девчонка, случайно повстречавшаяся в торговом центре и работающая официанткой в семейном японском чайном домике.