Doppelgänger: Dawn of the Inverted Souls представляет перед игроками историю о девушке по имени Люция Николь, что сталкивается с ужасной смертью её сестры Берты. Девушка старается быть похожей на погибшего родного человека, перенимая повадки и занимая в семье более взрослую позицию. Несмотря на произошедшие события, над девочкой продолжают жестоко издеваться в школе. Одноклассники совершают насмешки над грустной героиней, издеваясь над её внешним видом, что уже вошло в привычное расписание дня.

Однажды в Doppelgänger: Dawn of the Inverted Souls происходит еще одно жуткое нападение, где пострадавшими становятся школьники, что подкалывали Лицию Николь. С этого момента героиня становится главной подозреваемой, а остальные дети начинают её бояться. Геймерам предстоит разбираться в сложившейся ситуации, стараясь обнаружить настоящего убийцу. Придется столкнуться с трудными моральными решениями, которые будет подбрасывать сюжет и предпринимать решительные действия, чтобы проконтролировать происходящие события.

Главной задачей для пользователей становится принятие решений по ходу прохождения, где необходимо разбираться в загадочном деле и противостоять безумию, что затрагивает личную жизнь протагонистки. Девушка начинает страдать психологическими проблемами и видеть ужасные галлюцинации, что донимают её беспокойное и нестабильное сознание. В сложившихся обстоятельствах, юзерам предстоит исследовать локации и общаться с другими персонажами, чтобы добраться до правды и справиться с проблемами.