The X-Com Files - глобальная модификация для одноименной пошаговой стратегии, позволяющая увидеть, как начинались все события франшизы. Игра переносит в 1996 год. Организация Х-Ком только зарождается. В задачи сотрудников входит расследование аномальных происшествий. Стилистика вдохновлена сериалом Секретные материалы. Потребуется управлять двумя специальными агентами, передвигаясь на обычном транспорте. Поскольку события развиваются задолго до вторжения инопланетян, здесь нет истребителей, супертехнологий и т.п.

Необходимо заниматься полноценными расследованиями: искать улики, изучать инциденты, осматривать места происшествий и т.д. В The X-Com Files представлено множество новых врагов, уникальные миссии, специальное оборудования и много другого контента. Главные герои используют пистолеты, постепенно получая доступ к новым пушкам. снаряжение открывается постепенно. в ближнем бою протагонисты недостаточно сильные и точные, поэтому рекомендуется сохранять дистанцию при сражениях. Можно купить фургон, кожаные куртки, бронежилеты для своих собак. Псы могут пугать монстров, что позволяет вывести их из равновесия. Также собаки очень полезны в ночное время суток. На очки опыта открываются ученые, которые могут построить дополнительные лаборатории на базе. Вооружение представлено электрическими дубинками, дробовиками, огнеметами, различным холодным оружием и т.д. Есть специальные пушки в виде Calico или STEN.