Virtua Quest забрасывает игроков в цифровой мир под названием Nexus, где уход от реальности является нормой. Здесь люди становятся охотниками, выискивая ценные чипы данных. Главный герой, Сей, оказывается втянут в этот мир своим другом Хаями. Это неожиданное путешествие заставляет Сэя пересмотреть свое понимание самообороны и защиты других людей. По пути Сей встречает множество персонажей, в том числе Бита, своего проводника в виртуальном мире, и Току, бывшего члена теневой группы под названием Judgement Six.

Сюжет разворачивается по мере того, как Сей узнает о плане Judgement Six по захвату контроля над игрой путем сбора данных о бойцах. Этот квест втягивает Сэя в сражения с могущественными врагами и приводит его к открытию Souls, которые имеют решающее значение для развития сюжета. В Virtua Quest приобретение и использование этих Souls - ключевой момент. Они дают Сэю навыки, необходимые для преодоления трудностей Нексуса.

По мере того как юзеры ведут Сэя через его приключения, они раскрывают сюжет, который исследует темы дружбы, предательства и истинной природы боя. Проект вознаграждает за исследование и освоение различных техник для преодоления препятствий и врагов. Тайтл предлагает захватывающую историю, которая продвигает геймеров через серию испытаний в Nexus. Уделяя особое внимание открытиям и развитию навыков, адвенчура дарит захватывающий опыт, который выделяется в своем жанре.