Ghostwire: Tokyo - приключенческий экшен от первого лица. События происходят в Токио, где таинственным образом стали исчезать люди. Главный герой - детектив, использующий экстрасенсорные способности, помогающие ему обнаруживать духов и бороться с ними. Боевую систему разработчики описываю, как "каратэ при помощи магии". Протагонист использует движение рук в стиле Кудзи-кири, образовывающие знаки и различные заклинания.

Чтобы убить врага, требуется для начала разрушить его оболочку, чтобы добраться до ядра. Как только ядро противника откроется, игрок может нейтрализовать призрака. Сюжет стартует с того момента, когда почти все жители Токио исчезают. Потусторонние духи, которые называются Посетители, заполоняют улицы города.

Постепенно начинают проявляться паранормальные способности героя. Продвигаясь по сюжету, детектив столкнется с группой в масках, называющие себя Хання. Они знают причины, по которым произошла катастрофа. Призраки делятся на несколько типов: Амевараши - дети в желтых дождевиках, Широмуку - призрак невесты в белом и Кучисакэ - дух, сражающийся при помощи смертоносных лезвий. Все противники в Ghostwire Tokyo - уникальные и требуют от игрока постоянной смены тактики и комбинаций различных заклинаний.