Secret of Mana - вторая часть из Мана и прямое продолжение Final Fantasy Adventure. События игры берут свое начало после окончания войны между людьми и полубогами, использующие магию для управления "Крепостью маны" - огромным воздушным кораблем. Герой смог воспользоваться Мечом маны, чтобы положить конец кровопролитной войне.

Нынешние три героя "Легенда о святом мече 2" ослушались запрета покидать родные стены и отправились на поиски сокровищ. Там один из героев находит ржавый меч, которым защищает свою деревню от нападения монстров. Жители решают, что именно протагонист привел зло на их земли и прогоняют героя. Игровой процесс Secret of Mana схож в механиках с Последней Фантазией. Разница состоит в системе боя. Они происходят не в пошаговом режиме, а в реальном времени. Можно использовать оружие ближнего и дальнего боя, а также кастовать магию.

Боевка вдохновляется другой японской приключенческой франшизой - Зельдой. Значительно изменился интерфейс, представленный кольцом. Вызывая меню, геймплей замедляется и игрок волен выбрать интересующую его опцию. Камера следует за героями в изометрическом стиле. Вместе с протагонистом ходят еще несколько персонажей. Они сражаются с многочисленными монстрами и фантасмагоричными существами, исследуют огромный мир, общаются с различными NPC и выполняют множество дополнительных квестов и поручений от жителей земель.