В Subterrain наступило время, к которому вся человеческая раса так долго шла. Марс стал колонией землян. Разумеется, на это пришлось потратить гораздо больше ресурсов, чем требовалось изначально. Но разве это важно, когда мечта многих поколений наконец-то стала реальностью? Сейчас же основной целью станет обустройство нового пространства. Удастся ли игроку совладать с этим?

Профессор Джефф Мюррей был главой операции по застройке и созданию полноценной инфраструктуры на Красной мире. Он считает, что лучше всего проводить все действия под поверхностью планеты. Это напрямую связано с атмосферными нюансами, ведь наверху попросту не удастся выжить. Огромную роль для реализации задуманного так же играет мистер Вест, ведь именно для посильной помощи он отправился сюда вместе с Мюрреем.

Доктор не просто так решился на участие в проекте: это поможет ему продолжить исследования, позволяющие создать лекарство, способное справиться с болезнью Альцгеймера, ведь им болеет его супруга. Однако по прибытию на Марс он не успевает толком ничего сделать, поскольку в лаборатории произошло чрезвычайное происшествие, из-за которого его обвинили в убийстве и посадили в карцер.

Теперь потребуется помочь ему сбежать и отправиться навстречу неизведанного мира, где нет ничего знакомого. Врачу придется либо убегать от опасностей или попытаться дать отпор, других вариантов нет. От любого принятого решения будет зависеть дальнейшее развитие событий. Важно отметить, что любой, кто окажется на пути, будет потенциальным врагом. Имеется шанс того, что подземный город, где он оказался после побега, вовсе пуст. Нужно постоянно исследовать окружающий мир, искать ответы на загадки и пытаться прожить еще немного.