В Spaceflight Simulator пользователям предстоит досконально изучить процесс полета в космос. Главный герой становится командиром программы, цель которой - организовать путешествие в далекую галактику на собственном летательном аппарате. Такой процесс требует длительной подготовки и значительных расходов, поэтому молниеносного результата явно не стоит ждать. Все предстоит делать постепенно, разрабатывая прототипы и проводя многочисленные тесты.

Значительная часть игрового процесса в Spaceflight Simulator отводится под тестовые запуски и проверку модулей. Это может быть основной шаттл, от которого отцепляются двигатели и вспомогательные модули, или один габаритный кусок, где все детали имеют четкое назначение. Во время полета, в верхней части экрана отображается статистика. Тут можно отслеживать массу, скорость, мощность двигателя и прочие параметры. Так, если очередная попытка завершится неудачей, придется либо вносить минимальные поправки, либо в корне менять всю концепцию. Более того, посадить аппарат на поверхность другой планеты гораздо сложнее, чем обеспечить бесперебойный полет на дальнее расстояние. Нужно собрать настоящую чудо-машину, выбирая совместимые конфигурации топливных баков, корпусов, двигателей, капсул и прочих ключевых штук. Количество комбинаций может дойти до сотни, главное - найти подходящий вариант.