Lair of the Clockwork God содержит в себе сразу 2 жанра – приключенческий квест и платформер с элементами экшена. Причем инди-проект их не объединяет вместе, а чередует. Бен обожает видеоигры из девяностых. Геймплей у него напоминает point-and-click adventure старой школы. Парень общается с NPC, выбирая темы для разговора в отдельном списке, собирает предметы, изучает окружение (не забывая постоянно давать комментарии), решает с помощью найденных вещей загадки.

Его приятель предпочитает старым квестам более современные и динамичные продукты. Игровой процесс он предлагает соответствующий. Дэн лихо носится по уровням, толкает объекты, цепляется за уступы, стреляет из оружия, подбирает на ходу драгоценности. Lair of the Clockwork God продолжает приключения героев тайтла Ben There, Dan That! и его сиквела. Это самостоятельная история, поэтому для понимания юмористического сюжета необязательно играть в прошлые проекты разработчиков, сделавших самих себя главными персонажами. Повествование представляет собой сатиру на современную игровую индустрию.

Для прохождения этапов потребуется комбинировать умения их обоих. Поклонник старых квестов не станет лезть в туннель с ловушками и сражаться с монстрами, но зато поможет раздобыть своему напарнику пушку помощнее и с удовольствием разберется с пазлом. А любитель взрывов не захочет болтать с неписями и заниматься пиксель-хантингом, однако с радостью отправится прыгать по стенам и уклоняться от шипов. Переключаться между героями можно в любой момент. Постепенно они начнут открывать для себя новые способности.