События игры CUSTOM ORDER MAID 3D2 It's a Night Magic разворачиваются в клубе Империи - одном из роскошных баров, где собирается элита. По залу ходят красивые горничные, которые работают, танцуют, общаются с посетителями и всячески развлекают гостей. История начинается с того, что главному герою необходимо встретиться с дядей в новом клубе, который он недавно открыл.

Прибыв на место, протагонист узнает, что клуб переходит ему в наследство. Проблема в том, что заведение по уши в долгах и у него много проблем. В нем трудятся три служанки: Мария Сейдо - веселая девушка, Мафуя Химуро - барышня с суровым характером, Риса Такидзава - очень отзывчивая женщина. Вместе со служанками необходимо вернуть заведению былое величие и выбраться с долгов.

В основе игрового процесса CUSTOM ORDER MAID 3D2 It's a Night Magic лежит редактирование. Настраивайте внешний вид как отеля, так и своих подчиненных. Устанавливайте детали интерьера и покупайте новую мебель. У девушку изменяйте прически, покупайте им новые наряды и т.д. Игровой процесс представляет собой визуальную новеллу, содержащую немало эротического контента. Помимо сюжетного режима, доступен VS Dance, суть которого состоит в в танцах. Геймплей этого режима выполнен в стиле ритм-игры, где необходимо попадать в такт музыке.