Врата предательства 2: Шифр – это приключенческая игра. История посвящена агенту по кличке Ворон. Для её понимания необязательно знакомиться с оригиналом. У продолжения самостоятельный сюжет. Единственное, что роднит сиквел с первой частью, это наличие одного и того же протагониста.

Тайтл можно отнести к трехмерным адвенчурам. В Traitor's Gate 2: Cypher используется вид от третьего лица. Камерой можно управлять. Герой умеет ходить и бегать, подбирать и применять предметы, взаимодействовать с окружением. У него есть при себе инвентарь и блокнот с подсказками. Нужные для прохождения вещи никак не выделяются и не подсвечиваются. Пазлы чаще всего строятся на активации рычагов и различных механизмов в правильном порядке. Кроме загадок нередко встречаются смертельные ловушки. Главный персонаж способен умереть. В случае его гибели потребуется загрузить последнее сохранение.

Сюжетная кампания состоит из 30 локаций. На фондовой бирже Нью-Йорка начинается хаос из-за нового компьютерного вируса. Следы ведут к террористам из группировки "Нинутра". Отдел внутренних дел Пентагона поручает своему сотруднику пробраться в лабораторию боевиков. Именно там доктор Уркиш совершенствует вредоносную программу, что может взломать все спутники и вызвать массовый сбой связи по всему миру. Цель миссии: скопировать софт и уничтожить логово незаконного вооруженного формирования. Преступники засели в бункере на Ближнем Востоке. Добраться до них можно только через древние гробницы Вавилонской пирамиды.