В Why Am I Dead At Sea все начинается с момента, как игроку показывают фрагменты убийства протагониста. После чего в его посмертную жизнь врывается неизвестный и возвращает на корабль в настоящий мир. Главный герой узнает, что его вернул мальчик Пауло, обладающий паранормальными возможностями, которые не до конца ясны даже ему самому. Необычный парень говорит герою, что тот был убит и воскрешен на круизном пароме Дус Амере.

Также мальчик сообщает, что наступает что-то ужасное и ему нужна помощь. Но центральный персонаж говорит, что не помнит своего прошлого, из-за чего Пауло соглашается помочь его узнать, кто его убил и вспомнить все. На старте прохождения у пользователя всего имеется одно существо и его телом можно управлять. Это Элтон – мягкий и наивный диджей судна. Как только геймер берет управление над ним, то узнает, что тот влюблен в официантку Сюй. Неизвестные люди ворвались в ее каюту и украли дорогую вазу.

После недлительного времени исследования окружения, юзер узнает о том, что помимо убийцы главного героя имеется много других людей с собственными секретами. В игровом процессе пользователь контролирует призрака, не способного взаимодействовать с материальными объектами. Предстоит вселяться в других живых существ, чтобы побуждать их к действиям, выгодным ему. Чтобы подбирать подходящих людей, потребуется найти их слабые места в психике, чтобы тот был изначально слабовольный и открытый.

В прохождении геймер столкнется с двумя типами управления над подопечными. Первый – слабый, позволяющий лишь направлять тело в определенные области на пароме или побуждать к общению с другими. Каждый участник на судне обладает собственной ролью. Игроку потребуется улучшать взаимоотношения между людьми и пользоваться их способностями поочередно.