Аддон, который превратит обычную игру Сталкер Чистое Небо Война группировок в настоящий стратегический экшен. Игрок сможет взять одну из групп под свой контроль, отдавая множество разных приказов. Геймер сможет нанять сквады и экипировать и вооружать их. Отключив сюжетный режим, можно полностью погрузиться в военные действия.

Доступные группировки и квесты в Stalker:

• Сталкеры - задача состоит в захвате базы вояк, расположенной на Кордоне, за что можно получить деньги и арты.
  
• Бандиты - цель назначена в истреблении мутантов и захвате локации Рыжий Лес, а в награду банда получит денежные средства.
  
• Свобода - должна создать на Складах еще одну базу, а также полностью уничтожить силы Монолита, за что получит аналогичное вознаграждение.
  
• Долг - предстоит разобраться с надоедливыми зомби, а также защитить Янтарь, чтобы получить аналогичную награду.
  
• Чистое Небо - отправится в Лиманск, чтобы там разобраться с вояками. За это предоставляется FN2000 и денежные средства.
  

Также геймер может возглавить Ренегатов, Монолит, Наемников или Военных, у каждых из которых будут отдельные задачи. Главная же цель - добиться полного контроля всех локаций своими подчиненными. После выбора стороны, пользователь попадает на ее базу, где знакомится с ее силами, то есть количеством ресурсов, в том числе боезапасов, числом захваченных точек и свободными группами. Для выполнения миссии, юзер может выполнять простые задачи по поиску экипировки, оружия, боеприпасов, выполнять зачистку территории, осуществлять подкрепление для оказавшихся в беде союзников, исполнять сюжетные квесты и задания.

В S.T.A.L.K.E.R.: Clear Sky Faction Commander у юзера есть репутация, которая приобретается в процессе. Если у некоторых команд будет отображаться "ужасная" репутация, то они будут активно сражаться с подчиненной ему группировкой. В сражениях также косвенным путем будут принимать участие группа Стрелка, состоящая из Призрака и Клыка,которая стремится в центр Зоны, но Чистое Небо постоянно портит их планы, также вояки, что случайно и нехотя ввязываются в конфликт, поскольку потеряли большую часть своего состава, а также торговцы, разбогатевшие на продаже амуниции разным командам.