Chronophobia – это шутер с видом от первого лица и элементами хоррора. В нем нет как такового сюжета (геймплей сразу начинается после старта). Но имеется предыстория. В будущем человечество начало проводить эксперименты над самим временем и проводить гонку вооружений на основе недавних открытий. Действия людей начали искажать пространство и временные рамки.

В Chronophobia на роль протагониста был выбран хорошо обученный солдат. Он принимал участие в военном конфликте. В ходе отступления войск его засосало в Пустоту. Теперь он бродит по адской временной петле. Герой пытается вернуться в свою реальность из Бездны, где жертвы постоянно умирают и возрождаются, а различные кошмары их бесконечно преследуют.

Изначально у бойца есть при себе саперная лопатка и пистолет. На уровнях можно найти дробовик и другие пушки. Прицела нет, поэтому целиться надо "на глаз" или через мушку. На левой руке у персонажа имеется высокотехнологичное устройство, способное исцелять своего хозяина, поливать недругов пламенем из встроенного огнемета и определять местонахождение противников. Однако для полноценного функционирования гаджета его сначала надо починить. Боец бродит по психоделическим локациям и убивает не менее странных недругов. Например: крошечные танки. В случае гибели воин возрождается в начале карты.