Call of Cthulhu: Shadow of the Comet является двухмерным квестом. Проект был вдохновлен творчеством писателя Говарда Лавкрафта. История частично базируется на нескольких рассказах, но для её понимания необязательно сначала знакомиться с первоисточником. Сюжетная завязка берет свое начало в 1834 году. Именно тогда лорд Болескин приехал в рыбацкий посёлок Иллсмут, что расположен в Северной Америке. Астроном прибыл туда, поскольку именно из этой местности удобнее всего наблюдать за космическими телами. Ученый столкнулся с чем-то таким, от чего сошел с ума и угодил в лечебницу.

Основное повествование в Call of Cthulhu: Shadow of the Comet стартует в 1910-м. Джон Паркер узнал о судьбе Болескина и приехал в то же поселение, что и он. Там герой хочет запечатлеть прохождение кометы Галлея возле Земли. Однако на месте протагонист столкнулся с заговором. Главному персонажу предстоит продержаться 3 дня и выяснить, что же здесь произошло с астрономом более 70 лет назад.

В игре надо изучать местность, болтать с персонажами, решать пазлы. Бродить по локациям приходится в дневное и ночное время суток. В проекте есть много способов умереть: получить смертельный укус паука, провалиться в дыру на полу и так далее. Тут даже можно погибнуть, если не разгадать своевременно головоломку с таймером. У репортера есть дневник, куда заносится вся полезная информация, добытая при прохождении. Управление его движениями осуществляется только через клавиатуру. Геймплей периодически разбавляется сценами с экшеном.