Alcatraz: Prison Escape - экшн от третьего лица, события которого разворачиваются в тюрьме на острове Алькатрас, Сан-Франциско. Главный герой Брат-3 Побег из тюрьмы - невинно осужденный профессор. Его обвиняют в убийстве двух студентов. Само собой, что протагонист не совершал такого страшного преступления, однако доказательств о своей непричастности к смерти учеников у него нет.

Единственный способ найти и наказать преступников - сбежать из тюрьмы. Пробираясь на свободу, требуется вступать в борьбу с охранниками и другими заключенными. Локации в Alcatraz: Prison Escape доступны для исследования. В темных закутках камер можно отыскать много ценных и полезных вещей. Также можно общаться с другими заключенными, поскольку некоторые из них могут поведать ценную информацию.

Помещения оснащены различными ловушками, будь-то прожекторы, лазеры, заборы с электрическим напряжением и т.д. Чтобы открыть нужные двери, требуется выполнять различные действия и тихо пробираться мимо охранников. Чтобы узнавать местонахождение секретных проходов или про разные заначки, требуется совершать сделки с сотоварищами. Например, принести сигареты, книги и другие очень важные предметы в камере. Взамен герой получает ценные объекты, открывающие путь к свободе.