Viola: The Heroine's Melody дает возможность отправиться в вымышленный фантастический мир, где главной героиней выступает девушка по имени Виола. Протагонистка обладает волшебной скрипкой, из-за которой она оказывается взаперти магической ловушки. Попав в сказочную вселенную, находящуюся в музыкальном инструменте, начинается путь через большое количество препятствий. На представленных локациях обитают разнообразные существа, где одни настроены дружелюбно по отношению к девушке, а другие нет.

Каждый выбранный путь в Viola: The Heroine's Melody влияет на разветвление сюжетной линии, развивающейся нелинейно на протяжении игры. Предстоит погружаться в атмосферу загадочных событий, которые ожидают игрока. Пользователь сможет собрать отряд из спутников, повстречавшихся на пути. Каждый из персонажей обладает уникальным набором умений и способностей, помогающих в путешествиях разбираться с противниками и трудными ситуациями, поджидающими впереди.

Геймплей сделан в традиционном японском ролевом виде, где игроку приходится собирать группу из героев, чтобы отправиться на опасные испытания. Предстоит сталкиваться с разнообразными монстрами, агрессивно настроенными против протагониста. Участвовать придется в пошаговых боях, направленных на координацию действий и принятие правильных тактических решений, доступных для геймера.