Majikoi! Love Me Seriously! выполнена в виде интерактивной новеллы, нарисованой в аниме стилистике. Игроки попадают в городок Каваками-Сити, выглядящий как множество других японских поселений. В этом месте во главу социального статуса становится самурайская родословная и великое прошлое, которое сказывается на реакции окружения и отношении других жителей. Рассказ повествует про дом семейства Ямато и его шести друзей, которые совместно переживают большое количество приключений.

Группа молодых ребят в Majikoi! Love Me Seriously! создали секретную базу, на которой они тусуются и отдыхают в безопасности от мирских проблем и надоедливых взрослых, уважающих лишь родословную. Герою и его спутникам предстоит обучаться в Академии Каваками, проходя базовые уроки и тренировки, направленные на освоение боевых искусств. Игроки будут направлять действия протагониста, участвуя в драматических перепалках, наблюдая за романтическими историями и налаживая взаимоотношения между персонажами.

Геймеры будут оказывать непосредственное влияние на происходящие события, предпринимая выборы и определяясь с вариантами доступных решений. Придется читать диалоги между героями, подбирая желаемые реплики и влияя на отношения в группе. Ямато, выступающий центральным лицом повести, обладает тактическими умениями и понимает основы хитростей, позволяющих искусно разбираться с оппонентами и выкручиваться в конфликтных ситуациях.