Chain: The Lost Footprints переносит пользователей в атмосферную визуальную новеллу, в которой предстоит погрузиться в роль детектива по имени Такеши. Главный герой сталкивается с загадочной просьбой его одноклассницы Мари, требующей выследить её мужа и выяснить чем он занимается на работе. Протагонист берется за дело и наблюдает за мужчиной Шинджи, что поздно приходит домой к своей женщине в пьяном состоянии. Игроки будут наблюдать за сюжетом и определяться с доступными выборами, которые может совершать герой.

Отправляясь в Цепь – Потерянные Звенья, геймеры получают возможность:

• Пройти по запутанному следу, выясняя подробности из жизни политического деятеля.
  
• Разобраться с проблемами в личной жизни подруги протагониста, что сталкивается с серьезными опасностями.
  
• Выяснить темные делишки и махинации, которыми занимаются верхушки общества и богатые бизнесмены.
  
• Поучаствовать в криминальных разборках и интригах, работая под прикрытием и выясняя ценную информацию о государственных нарушителях.
  
• Познакомиться с нуарной вселенной и пообщаться с другими жителями, налаживая дружеские или романтические взаимоотношения.
  
• Оказывать влияние на сюжетную линию повествования, где предстоит решать моральные дилеммы, меняя ход развития истории.
  
• Получить одну из доступных концовок, которая полностью зависит от действий и выборов пользователя.