Atrox показывает события далекого будущего. Человечество хотело добиться технологического прогресса и нарастить собственную мощь, но это привело только к разрухе и полному порабощению планеты. По сюжету, на земле появилось два верховных существа – Черные и Белый ангелы. С их помощью люди начали экспериментировать в области генной инженерии, но в один момент эти сущности вырвались из-под контроля. Черный захватил компьютерную систему, а после поработил и сломил людей. Он начал проводить собственные исследования и вскоре создал новую расу Createse, которая совмещала в себе всех земных зверей. Они были геномодифицированы, а потому полностью заменили жалких людишек. Остатки людей переместились в холодные северные полюса, куда Createse пока остерегались приходить. А вот что произошло со Светлым ангелом – неизвестно, но по слухам он отправился в космос. Вскоре из дальней галактики раздается сигнал от Intellion, которые тоже недружелюбны.

Геймер в Atrox сможет взять под контроль одну из рас – две упомянутые и Hominian (законные жители планеты – человечество). Они тоже улучшили свои тела при помощи технологий. Потребуется привести союзников к победе и стереть все упоминания о врагах. Для этого есть современное оружие, специальные роботы, пушки, и другие орудия. Все бойцы по мере прохождения улучшаются и становятся сильнее. У каждого вида будут особые атаки. К примеру, одна из рас может плеваться ядом, использовать клыки и когти в битвах, а космические гости при помощи энергетических барьеров стали неуязвимы.