Протагонистом Silicon Dreams / cyberpunk interrogation становится человек с весьма необычной профессией – его задача изучать андроидов. Сами действия происходят в далеком будущем, когда человечество создало роботов, обладающих собственным интеллектом и даже чувствами, из-за чего со временем рамки между биологическим и искусственным стали весьма размытыми. Существа в обществе кроме пользы также создают проблемы, ведь многие не знают как к ним относится – как к равным или рабам.

В ходе прохождения сюжетной линии Silicon Dreams / cyberpunk interrogation становится известно, что и сами боты стали задавать себе этот вопрос и теперь думают, продолжить служить или воевать за свою свободу. Как исследователь, протагонист обязан изучать их эмоции, а после использовать их в своих целях – завязать дружбу с ботами или наоборот, запугивать. В кульминации истории отношение геймера к подопытным делается довольно противоречивым и тут предстоит нелегкий выбор.

По ходу повествования пользователю, впрочем, нередко придется принимать ключевые решения, которые имеют долгоиграющие последствия и задают тон дальнейшему развитию сюжета. Основная дилемма заключается в том, помочь ли угнетенным роботам бороться за свою свободу или же продолжить их эксплуатировать. Чтобы достичь определенной цели пользователь может предпринимать кучу действий – от создания ложных отчетов и обмана начальства до систематических побоев исследуемых.