События Lost In The Space разворачиваются в далеком будущем, когда человечество достигло существенных технологических прорывов. Уже долгое время они исследуют космос и отдаленные планеты на футуристических звездолетах. Игровой процесс выполнен в жанре путешествия с видом от третьего лица. Иногда на пути предстоит сражаться с врагами и преодолевать опасности в виде метеоритов, астероидов и других космических тел.

Сюжет начинает с рассказа о том, как с одного исследовательского космического корабля был отправлен сигнал бедствия. Команда главного героя получает это сообщение и выдвигается на место происшествия. В дальнейшем происходит неразбериха, в ходе которой потребуется отыскать настоящее местоположение тех, кому нужна помощь, а также попытаться спасти их. При выполнении миссии центральный персонаж столкнется со смертельными опасностями, разрушающимися кораблями и тайными объектами.

Юзер способен свободно исследовать обширный мир с удивительными планетами и космическими телами. Перемещение происходит на истребителях и звездолетах. Геймер может передвигаться от первого лица внутри транспорта, напрямую управляя персонажем. Это необходимо, чтобы чинить поломанные системы и заставлять судно работать при тяжелых поломках. В одиночном режиме будет множество второстепенных персонажей, отвечающих за работоспособность отдельных систем корабля.