В Evil Genius нам предстоит решать задания и головоломки, прокачивать оружие и модернизировать навыки влияния на мир, чтобы захватить его. Принцип игры — модернизация методов захвата маленькой улицы. Способы имеют свойство улучшать, поэтому от маленькой улицы мы придем к мегаполисам, а потом к странам и континентам. Все подчиненные и сам гений имеют характеристики. Здоровье, лояльность, внимательность и сообразительность. Все показатели имеют прямое отношение к его деятельности. Есть ещё усталость, но она быстро пополняется специальными методами. Чтобы захватить весь мир, нам предстоит выбрать одного из трех злых гениев. Он один будет олицетворять всю жестокость нашего персонажа.

На базе нашего Evil Genius будет несколько типов миньонов и приспешников. Какие-то смогут тушить пожары, какие-то представлять организацию и делать шаги в сторону официального захвата мира. Строители, например, будут заниматься простым строительством зданий и работой в них. Социальные миньоны добывать информацию и лечить остальных. У каждой пешки будет свой ход. На каждом континенте будет своя антитеррористическая организация, с которой мы будем бороться. Всё сражение ведется между монополистами битвы — супер-героем и супер-гением, желающим захватить мир. Мы не знаем, сколько и какая армия у противника, но ваши приспешники всегда будут делать самое важное, чтобы вы победили. Злодеяния постепенно приводят вас к тому, что господство над миром устанавливается вами. Чтобы модернизировать этот процесс, вкладывайте ресурсы в создание уникального оружия.