Визуальная новелла Fading Hearts позволяет геймерам погрузиться в приключения паренька по имени Рё, проживающего в городе Сораяма. Юноша является простым старшеклассником, который хранит секреты и поддерживает Клэр. Игроки будут наблюдать за происходящими событиями в жизни протагониста, определяя его судьбу при помощи выборов в процессе прохождения. Приходится читать диалоги между персонажами и определяться с ответами при беседах, чтобы менять взаимоотношения героев.

Сюжетная линия в Фэйдинг Хартс будет продвигаться постепенно, полностью завися от решений, принятых пользователем. Предстоит восстанавливать отношения между Рё и Клэр или наоборот, пускать все на самотек. В процессе прохождения придется сталкиваться с загадочными явлениями, которые начнут беспокоить юных ребят. Получится исследовать множество локаций, чтобы узнать потусторонние тайны, находящиеся на территории городка Сораяма. Главной задачей для геймеров будет направление сюжета, оказывая влияние на происходящие ситуации в жизни протагонистов.

Центральную роль в повести занимает выяснение и налаживание контактов между молодыми людьми, способных построить надежные и доверительные дружеские или романтические отношения. В игре присутствует множество концовок и кульминаций, показывающих положительные или отрицательные финалы. Игрокам предстоит самостоятельно определяться с выборами, принимая решительные поступки от лица школьника старших классов.