Flowers -Le volume sur automne- повествует про Юзуриху Яцусиро, президента школьного совета Никеи, обучающуюся в старших классах. Игра выполнена в виде визуальной новеллы, где пользователь будет наблюдать за развитием истории между героиней и другими персонажами, желающими отыскать счастье и любовь. В процессе прохождения, игроки ознакомятся с большим количеством запутанных сюжетных перипетий, раскрывающих истинные побуждения и характеры героев романа.

Погружаясь в приключения юной дамы в Flowers -Le volume sur automne-, геймеры будут совершать выборы и направлять развитие нелинейной истории при помощи доступных действий. От каждого выбранного поступка в той или иной ситуации, будет зависеть продолжение романтических арок между девчонками. Главной задачей для наблюдателя будет раскрытие секретов, связанных с тайной влюбленностью молодой и симпатичной Юзурихо Яцусиро.

Происходящие события переносят в изолированную Академию Святого Ангрекума, где постоянно происходят странные и мистические происшествия, затрагивающие жизни протагонистов новеллы. В рассказе будут переплетаться эмоциональные нити персонажей, мечтающих построить качественные дружеские и любовные взаимоотношения с другими учениками, обучающимися совместно под крышей одного учреждения. Игрок вынужден разбираться в запутанной истории любви и помочь героине справиться с подростковыми трудностями взросления.