В Hello Lady! можно узнать, как развиваются события в будущем. 21 век – пора открытий и новых возможностей, но на самом деле это время принесло человечеству множество проблем. Именно поэтому основной упор люди сейчас делают на молодежь – светлые умы, которые могут привести человечество к процветанию, прогрессу, технологическим и другим открытиям. Именно от лица юных, но весьма амбициозных леди и будет идти повествование в игре.

В Hello Lady! существует Благородная Академия Амакава, в которые зачисляются все перспективные люди. Здесь их обучают тому, чтобы они могли использовать таланты во благо, узнавали новое и постепенно совершенствовали собственные силы. Тут не встретишь старых неотесанных мужланов – молодые парни и девушки обучаются дисциплинам, сдают экзамены и другие нормативы. Во главе это организации стоят Короны – это 5 самых красивых и способных девушек.

В один из дней на главу Корон по имени Саку Отонаси был совершен теракт. Она уже распрощалась с жизнью, как к ней на помощь поспевает молодой парень. Он является студентом-переводчиком. А еще – 6 Короной. Шинри Нарита, а именно так зовут спасителя, заявляется девушке, что система, которую сейчас преподают в заведении, ему не нравится. Посему между ними завязывается конфликт. Но юноша уже все для себя решил – он желает полностью все изменить и перевоспитать пятерых зазнавшихся девчонок.