В Depths of Sanity игрокам приходится насладиться приключениями в научно-фантастическом сеттинге, где протагонисту по имени Эйб Дуглас придется спуститься глубоко под воду, чтобы изучить океанические биомы. Геймплей в игре выполнен в виде классический метроидвании, где необходимо передвигаться по миру, взаимодействовать с интерактивными элементами окружения, а также собирать постепенно команду для последовательных погружений на глубину, используя специальные субмарины и подводные лодки.

Юзерам в Depths of Sanity предстоит передвигаться через пиксельные двухмерные локации, где нужно аккуратно проплывать возле бомб и прочих опасных ловушек, что могут уничтожить судно героя. Протагонист и его экипаж будет часто сталкиваться с большим количеством опасностей и вызовов, что ожидают его на дне море. Приходится постепенно узнавать судьбу и личностные переживания каждого персонажа, что будет работать сообща с героем, выполняя ответственную роль на борту подлодки.

Пользователям предстоит пробираться через коралловые рифы, затонувшие корабли, подземные логова с магмой и густые водоросли, что будут мешать в поиске правильного маршрута к поставленным целям. Придется выполнять разные задачи и искать ценные ресурсы и артефакты, чтобы раскрыть секреты, спрятанные под водой планеты, что находится в футуристической вселенной. Юзерам нужно столкнуться с ужасными монстрами и боссами локаций, против которых выйдет применять вооружение субмарины и подходящие тактики.